(“云之稻项目”首度无偿共享绿色超级稻基因数据)

　　红网长沙9月15日讯（时刻新闻记者 冯钧 通讯员 张鹏）迄今为止全世界最大的植物基因组测序项目成果——3000份绿色超级稻基因组原始测序数据将首度通过云计算技术无偿向全球共享，只要是从事水稻研究的机构和个人，利用电脑甚至手机都可以共享这些数据和计算工具用于分析研究，从而培育出更优良的水稻品种。而这一项目被定名为“云之稻项目”。
　　
　　今天上午，中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙联合宣布共同推动“云之稻项目”。该项目将加快规模化发掘水稻优良基因，突破水稻复杂性状分子改良的技术瓶颈，加快高产、优质、广适性新品种培育的进程，全面提升我国及全球水稻基因组研究和分子育种水平。
　　
　　“云之稻项目”源自比尔·梅琳达盖茨基金“为非洲和亚洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻”和国家国际合作专项资助的3000份水稻基因组项目的成果。根据协议，基于3000份水稻种质资源基因组测序数据的“云之稻项目”将无偿向全球共享数据，同时项目组还将建立最全面的“水稻功能基因组和育种信息数据库”，为基础研究和育种应用提供可供参考的重要信息。
　　
　　绿色超级稻项目首席科学家、中国农业科学院作物科学研究所黎志康博士说：“对3000份水稻核心种质基因组测序分析，能够回答‘水稻有多少的遗传多样性可以应用，从哪里获取生物育种所需要的遗传资源’的问题，分析得到的数据将为水稻的基础认识和生物育种提供基础信息资源。这项研究将揭示全球栽培稻资源的基因组多样性，和每个水稻资源的遗传特点和其应用价值。”这项研究将3000份水稻种质资源带入水稻育种应用中，将为水稻育种创新提供材料和新思路。3000份水稻核心种质重测序项目的分析结果还将填补人们对水稻甚至各个物种在基因组学方面的一些知识空缺。
　　
　　3000份水稻基因组测序项目分析得到的数据量达到几百TB，生物学研究进入了大数据时代，需要全世界所有科学家和有兴趣的人士参与进来分析挖掘。这些数据将通过阿里云平台进行分享。“这3000份水稻基因组序列数据中包含了大量的未知基因功能及其多样性信息，需要全世界所有科学家和有兴趣的人士参与进来分析挖掘，希望全球水稻研究同行充分利用这一平台。”黎志康说。
　　
　　华智生物信息总监王冰冰说，云之稻项目的推出，解决了处理海量基因组数据所需要的巨大的存储和计算能力，每个科研机构不需要再重复配置资源。用户可以免费下载访问水稻基因组数据，平台还提供了一些常用的分析工具和数据，包括对测序整体质量的检查，与水稻粳稻和籼稻参考基因组的比对，以及对基因组变异位点的鉴定等。他说：“通过使用这些工具可以免费调用阿里云的计算资源，从而方便快捷地对这些大数据进行分析。”
　　
　　聚道科技首席技术官王乐珩介绍，他们开发的GeneDock基因数据云服务平台，针对基因的数据格式使用了独特的压缩算法，大大降低了数据存储和传输的成本，基于阿里云便利可靠的计算存储资源，利用华智和农科院所提供的数据分析工作流，用户不仅可以在云之稻下载数据，而且可以直接在云端对3000份水稻核心种质基因组数据进行分析挖掘。
　　
　　“云之稻”项目已经对用户免费开放，后期还将陆续推出新的分析工具，以方便科研工作者深入分析水稻基因组数据。这种模式的成功经验，将用于生物基因研究的其他领域，今后其他农作物、人体等基因研究将可能借鉴这一模式。